内设机构：办公室 政策法规科 计划财务科 建设管理科 人事教育科 党委办公室 离退休工作科
运输安全管理科
工作职能：
办公室：组织协调机关政务工作；负责文秘、政务信息调研、重要会议组织、目标管理、政务督办、提议案办理、档案、年鉴、信访、机要、保密、值班、接待工作；负责局域网及通讯管理；负责起草局重要报告、综合性文件；负责机关行政后勤管理工作；负责局及直属单位的社会治安综合治理工作；负责交通新闻宣传报道工作。
政策法规科：归口管理全市交通行业法制工作；负责交通行政执法；指导、管理路政执法业务，负责交通稽征、运政、路政、内河航政、港监执法监督检查的综合协调和行政复议工作；管理交通执法证件和装备的发放、审验工作；组织交通行业政策研究工作；指导交通行业体制改革和交通特许经营企业的行业管理；负责交通执法人员的管理、培训、考核工作；负责交通行业行风建设工作。
计划财务科：负责交通行业发展战略研究；组织和综合拟定公路、水路交通行业中长期规划、道路运输行业发展规划、交通科技规划、年度计划和固定资产投资计划；负责交通行业统计、预测和信息引导工作；负责局属单位国有资产管理和保值增值的监督；监督管理全市水陆干线基础设施国有资产的使用；负责筹集、监督、管理交通建设资金；负责交通规费的征收及使用管理；负责有关专项资金、外汇、信贷、税收及利用外资的财务管理工作；负责全市公路、桥梁、隧道能行费项目的审定申报和站点的管理工作；负责局属单位和指导交通系统的内部审计工作；负责本系统财务和统计人员的业务培训工作；负责规费征收的票据管理工作。
建设管理科：贯彻执行国家、省交通建设行业政策、规章和技术标准；监督管理全市交通建设项目实施；维护全市公路、水路交通建设平等竞争秩序；负责交通建设从业单位和人员的资信登记和资质管理；负责组织交通地方公路重点项目建设的可行性研究和审查立项、审核报批工作；监督管理交通建设招投标工作；负责地方重点交通建设工程项目设计文件、开工报告的审查和审批；监督指导交通建设工程项目的质量管理、造价定额管理、合同管理；组织参与公路工程交（竣）工验收；组织全市公路、水路及其设施的维护和管理；编制公路建设、公路养护年度计划并检查执行情况。
人事教育科：负责局及直属单位人事、社会保险管理工作；归口指导管理行业专业技术干部、人才交流、智力引进、干部培训、工人技术等级的培训考核、劳动及卫生工作；组织制订全市交通职工教育发展规划、拟订行业人力资源开发规划、指导全市交通行业在职培训和职业技术教育工作；负责交通行业学会、协会管理工作；组织制订交通行业科技发展政策；组织实施交通重大科技项目、科研合作项目、科技信息交流工作；组织实施科技成果鉴定和评审、推广工作；归口管理交通行业标准、计量工作。
党委办公室：负责局党委和机关党委的日常工作，负责按规定管理局及直属单位班子建设、党风廉政建设；负责局及直属单位党的组织建设、作风建设和思想建设工作；负责管理和指导局及直属单位工会、青年、妇女等群团组织工作；负责交通行业的宣传思想政治工作，指导交通系统精神文明建设及创建工作；负责局及直属单位的党务工作。
离退休工作科：负责局机关离退休人员的管理和服务，指导局直属单位离退休人员管理工作。
运输安全管理科：负责全市道路、水路运输市场的行业管理；负责制订全市道路、水路运输行业发展政策，合理安排道路、水路运力和站场、港口、码头布局；归口全市道路、水路客货运输、车船维修、搬运装卸、运输服务、驾驶员培训的行业管理；负责组织、协调重点、战备、紧急客货运输和道路、水路联合运输；负责运输价格管理；指导交通运输行业质量、能源、设备管理工作；负责全市水上交通安全的管理、监督，道路运输企业源头安全管理和路桥施工安全的行业管理工作，及时通报和处理重大交通安全情况，综合分析和统计水上交通和道路运输企业安全事故。
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